Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A3Q9BRY0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms