Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms