Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms