Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms