Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms