Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms