Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms