Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms