Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms