Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms