Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EP400Q96L91 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms