Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDCCAG3Q96C92 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms