Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTP4A1Q93096 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A1Q93096 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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