Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms