Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF128Q8TEB7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF128Q8TEB7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms