Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms