Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00518Q8N0U6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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LINC00518Q8N0U6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LINC00518Q8N0U6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LINC00518Q8N0U6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00518Q8N0U6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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