Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNTD2Q8IXW0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms