Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL3Q8IVW4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL3Q8IVW4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL3Q8IVW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL3Q8IVW4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms