Protein–RNA interactions for Protein: Q86V88

MDP1, Magnesium-dependent phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDP1Q86V88 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDP1Q86V88 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDP1Q86V88 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms