Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms