Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNE3Q6ZMZ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms