Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC171Q6TFL3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms