Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6P435 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q6P435 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q6P435 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q6P435 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q6P435 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q6P435 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q6P435 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q6P435 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms