Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms