Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPRIN2Q6IMN6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms