Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms