Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms