Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms