Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC38Q5VT99 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms