Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q5VSD8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms