Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms