Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms