Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms