Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms