Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP13-3Q3SY46 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms