Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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