Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NBPF8Q3BBV2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms