Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM1Q2NKQ1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms