Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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