Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms