Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PTPRNQ16849 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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