Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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