Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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