Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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