Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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