Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt11.65□□□□□ -0.542e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.562e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 CRLF1-203ENST00000594325 1020 ntTSL 325.32■■□□□ 1.647e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 C4A-255ENST00000483974 465 ntTSL 222.96■■□□□ 1.277e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 CRLF1-204ENST00000596360 413 ntTSL 217.81■□□□□ 0.447e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 UBA52-212ENST00000599256 927 ntTSL 226.14■■□□□ 1.785e-9■□□□□ 8
PCBP1Q15365 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.524e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 224.41■■□□□ 1.54e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.184e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SHISA5-214ENST00000486344 713 ntTSL 219.9■□□□□ 0.784e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.648e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SHISA5-205ENST00000424965 884 ntTSL 518.49■□□□□ 0.554e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.558e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 UBA52-211ENST00000598814 550 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.385e-9■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.278e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.278e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.398e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 ALDOA-218ENST00000566146 365 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.784e-36■□□□□ 8
PCBP1Q15365 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 29.15□□□□□ -0.959e-7■□□□□ 8
PCBP1Q15365 KPNB1-213ENST00000583013 742 ntTSL 38.99□□□□□ -0.979e-7■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SRRM2-227ENST00000576674 593 ntTSL 48.79□□□□□ -14e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.239e-7■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 34.92□□□□□ -1.624e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 VASP-205ENST00000588273 318 ntTSL 23.83□□□□□ -1.84e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 214.6□□□□□ -0.078e-71■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 519.53■□□□□ 0.723e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 GRK2-203ENST00000524899 751 ntTSL 317.57■□□□□ 0.47e-15■□□□□ 8
PCBP1Q15365 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.323e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-15■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 56.68□□□□□ -1.343e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.833e-10■□□□□ 8
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