Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRKQ15262 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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