Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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