Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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